Основным содержанием современного этапа рыночной экономики является инновационное развитие, представляющее собой периодически внедряемые интенсивные изменения, которые качественно трансформируют технологии, продукцию, способ организации производства. Поэтому проблема управления развитием предприятий приобретает особое значение. Обострение конкурентной борьбы, динамика научно-технического прогресса повышают роль процессов управления развитием. С другой стороны, построение компьютерных систем поддержки принятия решений для управления процессами развития предприятий требует построение моделей и целостных систем моделирования адекватных современному уровню развития теории и практики управления. В статье предлагаются методы и модели для решения задачи формирования программы развития крупного промышленного предприятия, которые могут быть положены в основу систем поддержки принятия решений в инновационном менеджменте.