Формирование механизмов управления государственной поддержкой малого бизнеса происходило в определенной степени стихийно, что привело к разнообразию форм, методов и институтов поддержки малого предпринимательства и сделало актуальной проблему их координации. В Москве эта проблема решается с помощью следующих методов: административных: взаимодействие структур, уполномоченных осуществлять поддержку малого предпринимательства на уровне города и административных округов (АО); нормативно-правовых: подготовка и реализация законов, постановлений, распоряжений правительства Москвы, руководителей департаментов мэрии, префектов АО, супрефектов муниципальных районов; финансово-экономических: разработка и совершенствование механизмов финансовой и имущественной поддержки малого предпринимательства, включая контроль за целевым использованием средств финансовой поддержки; организационных: система разработки и реализации комплексных программ развития и поддержки малого предпринимательства города и аналогичных программ административных округов. В качестве основного инструмента координации поддержки малого бизнеса выступают комплексные программы, разрабатываемые на различных уровнях управления. Программное обеспечение развития и поддержки малого предпринимательства должно опираться на два важных принципа государственной политики: программно-целевой подход и координацию уровней управления.